TruSeq小RNA文庫制備試劑，CRISPR-Cas gRNA

更新時間：2018-01-09瀏覽：4300次

產品英文名：TruSeq Small RNA Library Prep Kit

產品中文名：TruSeq小RNA文庫制備試劑盒

TruSeq小RNA文庫制備試劑盒提供用于從總RNA直接生成小RNA文庫的試劑。試劑盒中附帶的改良接頭能夠靶向通過Dicer處理產生的MicroRNA (miRNA)。

這些試劑盒通過引入48個*的標簽實現多重測序，借此檢出miRNA和小RNA，并對通量進行圖譜分析，與Illumina測序無可企及的輸出相得益彰。標簽添加在通用擴增反應中，從而極大降低了連接偏向性，并確保了miRNA表達的測量準確度。

通過工作流程的改善，樣本制備流程得以精簡，從而可對任何物種中的所有小RNA轉錄本展開經濟實惠的研究。兼容的應用包括探尋新miRNA、在單堿基分辨率下對同分異構體等變異進行特征分析，以及在不進行預先假設的情況下分析差異表達。

品牌	貨號	產品描述
Illumina	RS-200-0012	TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set A (24 rxns) (Set A: indexes 1-12) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件A（24次反應）（套件A：1–12個標簽）
Illumina	RS-200-0024	TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set B (24 rxns) (Set B: indexes 13-24) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件B（24次反應）（套件B：13–24個標簽）
Illumina	RS-200-0036	TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set C (24 rxns) (Set C: indexes 25-36) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件C（24次反應）（套件C：25–36個標簽）
Illumina	RS-200-0048	TruSeq Small RNA Library Prep Kit -Set D (24 rxns) (Set D: indices 37-48) TruSeq小RNA文庫制備試劑盒 - 套件D（24次反應）（套件D：37–48個標簽）
Illumina	20005613	TruSeq Small RNA Set A MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件B MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑）
Illumina	20005614	TruSeq Small RNA Set B MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件B MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑）
Illumina	20005615	TruSeq Small RNA Set C MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件C MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑）
Illumina	20005616	TruSeq Small RNA Set D MiniSeq Kit (1 library prep and 2 MiniSeq reagents) TruSeq小RNA套件D MiniSeq試劑盒（1組文庫制備和2個MiniSeq試劑）

TruSeq小RNA樣本數據集

已使用TruSeq小RNA文庫制備試劑盒制備人類大腦參考RNA (HBRR)和人類通用參考RNA (UHRR)樣本。這些文庫已使用片段長度配置為1 x 36堿基對的MiniSeq高輸出試劑盒在MiniSeq系統上進行測序。總產量為0.91Gb，其中97%的堿基達到或超過Q30。

Specifications

Assay Time 分析時間	1 day 1天
Hands-On Time 手動操作	4 hours 4小時
Mechanism of Action 原理	Captures small RNA with 3′ OH and 5′P modifications (like those processed by Dicer/Drosha)捕獲小RNA
Multiplexing	48 unique indexes are available
Species種屬	Any Species, Human, Mouse 任何物種，人，鼠
Specialized Sample Types 特殊樣本類型	FFPE, Low Input
System Compatibility 兼容系統	MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550
Technology 技術	Sequencing 測序
Automation Capability 自動能力	Liquid Handling Robots 液體處理機器人
Variant Class 突變級別	Novel Transcripts, Transcript Variants 新轉錄字，轉錄子突變
Method 方法	miRNA and Small RNA Sequencing miRNA和RNA測序

特別應用推薦：

CRISPR-Cas gRNA 驗證

Cas9技術需要：II型 CRISPR–Cas 細菌免疫系統，包括 trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA), Cas9 protein, and protospacer-adjacent motif (PAM)。

trans-activating CRISPR RNA (tracrRNA), CRISPR RNA (crRNA)作用：形成RNA雙鏈，引導Cas9核酸內切酶和核酸序列配對。

Cas9和目標PAM序列連接。

關鍵點：guide RNA 和目標DNA的互補。

大多數商業Cas9基因編輯工具來源：Streptococcus pyogenes（鏈球菌）的II型 CRISPR–Cas 系統。不過自然界還存在很多具有基因編輯潛力的II型 CRISPR–Cas 系統。開發這種系統需要預測驗證天然或基因工程來源的，驅動Cas9的單雙鏈RNA。

因為導引RNA的長度較小（17-200堿基），適合使用TruSeq小RNA文庫制備試劑盒（Reads 150nt）進行序列驗證。

參考文獻：

Prediction and Validation of Native and EngineeredCas9 Guide Sequences,Alexandra E. Briner,et al.

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