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      核酸保存純化:Streck 采血管和QIAamp核酸純化試劑盒

      更新時間:2018-01-29瀏覽:2115次

      對孕婦外周血中游離 DNA 進行高通量測序(Next Generation Sequencing, NGS),并分析孕婦外周血中攜帶的胎兒的染色體突變異常風險,特別是染色體非整倍體變異的檢測,是近幾年出現(xiàn)的無創(chuàng)產(chǎn)前篩查(NIPT)新技術(shù)

       

      NIPT產(chǎn)品

      基于孕婦游離DNA的胎兒染色體非整倍體檢測(高通量測序法)流程及產(chǎn)品

      血液標本采集、運輸、保存

      血漿游離DNA提取純化

      血漿游離DNA基因文庫構(gòu)建

      文庫產(chǎn)物純化

      基因測序

       

      血液標本采集、運輸、保存

      Streck Cell-Free DNA BCT® 血漿游離DNA采血管

      產(chǎn)品英文名稱:Streck Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE

      產(chǎn)品中文名稱:Streck BCT® 血漿游離DNA采血管

      貨號:218962,230253

       

      Streck 血漿游離DNA采血管是一種直接提取的全血收集管,用于收集、運輸和儲存血液樣本。Streck 血漿游離DNA采血管內(nèi)含防腐劑,它能穩(wěn)定有核血細胞,防止細胞基因組DNA的釋放,保護血漿游離循環(huán)DNA:cfDNA ctDNA和循環(huán)腫瘤細胞(CTC)。

      230253是218962的升級版,是Streck公司新推將玻璃和塑料的*性能融合在一起的Fusion2TM混合塑料管

       

      成份

      Streck 218962包含抗凝K3EDTA和細胞液體防腐劑

       

      材質(zhì)

      Streck 218962管材是玻璃,Streck 230253管材是一種特制的混合塑料Fusion2,兼具玻璃的*優(yōu)點和塑料的安全性。

               

      品牌

      貨號

      產(chǎn)品描述

      包裝

      Streck

      218962

      Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE

      Cell-Free DNA BCT®血漿游離DNA采血管

      100管/盒

      Streck

      230253

      Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE

      Cell-Free DNA BCT®血漿游離DNA采血管(混合塑料)

      100管/盒

       

       

      血漿游離DNA提取純化

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit 循環(huán)核酸純化試劑盒

      貨號: 55114 品牌:Qiagen

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (50)

      For 50 preps: QIAamp Mini Columns, Tube Extenders (20 ml), QIAGEN Proteinase K, Carrier RNA, Buffers, VacConnectors, and Collection Tubes (1.5 ml and 2 ml)

      樣品處理量:5mL

      洗脫體積:20-150μL

      可以洗去PCR抑制物,如:二價陽離子和蛋白

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑

      從人類血漿或血清中濃縮和純化游離DNA和RNA

       

      濃縮的核酸,高上樣量,低洗脫體積

      回收DNA和RNA碎片

      無需有機提取或乙醇沉淀

      *去除污染物和抑制劑

       

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒大大簡化了從血漿或血清中濃縮和純化游離DNA和RNA的過程。

       

      性能

      分析血液中腫瘤特異性的胞外DNA片段和mRNA可對普通血液樣品進行特異性地腫瘤類型檢測。這些存在于血清或血漿中的游離核酸通常都是<1000 bp(DNA)或<1000 nt(RNA)的片段。此外,小至21 nt的miRNAs可作為某些癌癥和疾病狀態(tài)的生物標記。

       

      經(jīng)純化和濃縮的游離DNA和RNA不含蛋白、核酸酶和其他雜質(zhì),可即用于各種下游應(yīng)用,包括:

      PCR 和定量real-time PCR以及RT-PCR

      用于基于血液樣品的癌癥生物標記的研究、驗證和檢測

      病毒核酸檢測

       

      原理

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒簡化了從血漿或血清中純化游離DNA和RNA的過程。核酸特異性結(jié)合到QIAamp Mini離心柱上,污染物流走。PCR抑制物,如:二價陽離子和蛋白,可通過三步有效的洗滌步驟被*去除,結(jié)合在離心柱上的純核酸可用水或試劑盒中的緩沖液洗脫。使用QIAamp Circulating Nucleic Acid技術(shù)從人類血漿、血清或尿液中獲得游離的DNA和RNA。

       

      應(yīng)用

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒可從含低濃度DNA和RNA碎片的原始樣本(人血漿中常規(guī)游離DNA的濃度為1–100 ng/ml)中純化和濃縮游離的DNA、RNA、miRNA,包括病毒核酸。起始樣本體積至多5 ml。

       

      適用樣本

      QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒可從以下樣本類型中純化和濃縮核酸:

      人類血漿

      血清

      尿液

       

      NIPT介紹

      NIPT發(fā)展

      NIPT發(fā)展迅速,而且它還不是標準醫(yī)療項目,只是一個選擇項目。

      NIPT發(fā)展快速得異常,消費者在推進。可能原因:同步社交媒體發(fā)展,討論較多。

      NIPT應(yīng)用

      NIPT在實際運用中要解決的問題:

      市場壓力

      專業(yè)指南的快速變化。高風險孕婦和一般孕婦做咨詢用的時間都不一樣。那么獲得的信息也不同。孕婦查出有問題不一定要終止妊娠,還可以多做應(yīng)對準備。而且做繼續(xù)懷孕決定的比例達到了40%。

      NIPS在產(chǎn)前檢測中的準確定位。一開始定位是高危產(chǎn)婦,之后不是高危產(chǎn)婦也對NIPT有興趣。中等風險妊娠群體的NIPT檢測,還會再上升。

      NIPT的檢測

      NIPT的檢測還不是準確。

      低風險用戶越多,PPV值越低。

      生物學(xué)原因?qū)е碌哪阁w的miccroduplications也會影響檢測結(jié)果。

      NIPT和標準產(chǎn)前檢測項目的比較

      標準產(chǎn)前檢測項目:血清生化檢測和nuchal translucency超聲波檢查。

      NIPT在在某些檢測方面的錯誤率格外低,比如cfDNA陽性預(yù)測方面比標準項目做得好。

      NIPT的可選項目:性染色體

      常規(guī)染色體非整倍體異常項目:21- 三 體 綜 合 征(trisomy 21,T21)、18-三體綜合征(trisomy 18,T18)和 13-三體綜合征(trisomy 13,T13)。

      檢測可選項目:性染色體等。NIPT能比超聲波更早知道是否有性別染色體異常。

      NIPT技術(shù)

      美國NIPS的四個公司:4種技術(shù)。檢測錯誤率差別較大。

      Illumina:WGS 全基因組測序

      Sequenom:WGS 全基因組測序

      Ariosa Diagnostics:targeted approach on a microarray 微陣列靶向方法

      Natera:targeted sequencing for SNP 靶向測序檢測單基因

       

      參考文獻

      1.染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前檢測技術(shù)質(zhì)控要點及臨床應(yīng)用進展.曲守方; 于婷; 孫楠; 李麗莉; 陳芳; 吳英松; 黃杰.分子診斷與治療雜志.

      2.Cell-free DNA screening blooms in expansion to low-risk pregnancies,Anne Paxton,2017 Issues, ARTICLES, March 2017.

       

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