Rubicon PicoPLEX 全基因組擴增用于單細胞無創產前檢測

Rubicon PicoPLEX

英文名：Rubicon PicoPLEX WGA Kit

中文名：Rubicon單細胞全基因組擴增試劑盒

☆ 單細胞或6pg基因組DNA起始的全基因組DNA擴增試劑盒。

☆ 單個反應管、3小時，3步反應的簡單操作流程（手動操作時間只需要15分鐘）。

☆ 適合拷貝數變異分析（CNV）、染色體異倍性（aneuploidy）分析。

PicoPLEX WGA Kit采用技術，設計優化用于從單細胞中擴增全基因組DNA。起始樣本量低至單細胞或6pg基因組DNA。便捷的單管操作流程降低污染節省時間。結果穩定性、重復性好。

應用推薦：PGS/PGD，單細胞NIPT，循環腫瘤細胞分析

Rubicon PicoPLEX用于NIPT的文獻

文獻范圍：2014年以后發表的文獻

應用概述：PicoPLEX單細胞擴增所得文庫在下游單細胞的STR、CNV、SNP等遺傳變異檢測表現良好，適用于單細胞產前無創檢測。

1. 

文獻：Short Tandem Repeat analysis after Whole Genome Amplification of single B-lymphoblastoid cells.（B淋巴母細胞系單細胞全基因組擴增后的微衛星分析）

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學藥物生物技術實驗室),et al.

Scientific Reportsvolume 8, Article number: 1255 (2018)

遺傳變異檢測：短串聯重復序列，英文Short Tandem Repeat，簡稱STR。又稱微衛星（Microsalite），簡單重復序列（英語：Simple Sequence Repeats，SSRs）。

意義：使用單細胞全基因組擴增（WGA）試劑，以用于下游的單細胞微衛星分析。可用于基于單細胞檢測的無創產前檢測。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX雖然沒有檢測到所有微衛星標記，但仍適用于臨床單細胞的遺傳學鑒別。

2.

文獻：STR profiling and Copy Number Variation analysis on single, preserved cells using current Whole Genome Amplification methods.(使用現行全基因組擴增方法對單個保存細胞進行STR和染色體拷貝數變異分析）

Ann-Sophie Vander Plaetsen(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學藥物生物技術實驗室),et al.

Scientific Reportsvolume 7, Article number: 17189 (2017)

遺傳變異檢測

STR

CNV：英文 Copy Number Variation，染色體拷貝數變異

意義：單細胞無創產前檢測等液體活檢因為細胞的稀有和脆弱，需要更的單細胞分析技術。PicoPLEX等單細胞全基因組擴增試劑盒可以對微量DNA進行無偏向的WGA擴增，以用于下游STR和CNV分析。

方法：細胞用Streck Cell-Free DNA BCT 采血管保存，使用PicoPLEX等WGA試劑盒進行單細胞全基因組擴增后進行STR與CNV分析。

Rubicon PicoPLEX作用：在幾種WGA試劑盒中，PicoPLEX表現良好，對于STR和CNV均適用。

3.

文獻：Performance of four modern whole genome amplification methods for copy number variant detection in single cells.（四種全基因組擴增方法用于單細胞拷貝數變異檢測的性能表現）

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學藥物生物技術實驗室),et al.

遺傳變異檢測：CNV

意義：單細胞全基因組擴增技術可用于胚胎植入前遺傳診斷，單細胞無創產前檢測和循環腫瘤細胞的液體活檢。即PGD、NIPT和CTC。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX試劑擴增單細胞后，適合通過低深度全基因組大規模平行測序（MPS，又名NGS）進行CNV分析。

4.

文獻：Evidence for feasibility of fetal trophoblastic cell‐based noninvasive prenatal testing.(胎兒滋養細胞用于單細胞無創產前檢測可行性的證據）

Amy M. Breman（Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫學院 分子與人類遺傳學系）,et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 12 September 2016.

遺傳變異檢測：染色體和亞染色體變異

意義：通過孕早期（10-16周期）母體血液獲得胎兒細胞，單細胞全基因組擴增后，進行基因分型。

方法

擴增：WGA技術

分析：array CGH 或 NGS

Rubicon PicoPLEX作用：用于單細胞全基因組擴增。

5.

文獻：Comparison of three whole genome amplification methods for detection of genomic

aberrations in single cells.(三種用于單細胞基因組結構異常檢測的全基因組擴增方法比較）

Elizabeth Normand（Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫學院 分子與人類遺傳學系）,et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 02 July 2016

Keywords: Whole genome amplification, array CGH, genotyping, non-invasive prenatal

diagnosis, fetal cells

關鍵詞：全基因組擴增，微陣列比較基因組雜交，基因分型，無創產前診斷，胎兒細胞

遺傳變異檢測：染色體拷貝數異常

意義：比較了三種商業全基因組擴增（WGA）試劑盒從單細胞中獲得高質量DNA的能力。結果顯示WGA試劑所得DNA文庫適合用于單細胞分子分型和拷貝數分析。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX相比其他品牌試劑盒對于非固定細胞的SNP檢測較好。

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