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      Streck品牌cfDNA采血管的穩定性分享

      更新時間:2019-06-03瀏覽:4967次

         Streck品牌cfDNA采血管的穩定性分享

        Streck品牌cfDNA采血管可實現全血采集樣品中cfDNA規范化(標準化)。可用于無創產前基因篩查/無創產前基因檢測(NIPS/NIPT)和液體生物監測(液體活檢,Liquid Biopsy)的規范化,提高檢驗結果的準確性。

        1. 時間穩定性(Time Stability)

        CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血,其Cell-free DNA可以在室溫(22?C) 下能穩定保存長達28天!

        結論來自如下監測:在不同時間下,對室溫保存在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中的血液,取血漿使用droplet digital PCR檢測β-Actin基因片段,用以反映cell-free DNA濃度,發現與初始采集時比較,保存長達28天后該基因沒有發生顯著改變。而K3EDTA采血管無法實現在室溫下的長時間保存。在第3天,β-Actin已經呈現顯著升高,cell-free DNA濃度持續升高,至28天時,濃度升高上千倍之多。

        2. ctDNA穩定性

        Blood Exo DNA ProTeck® tubes保存血樣,血液中的腫瘤DNA室溫(22?C)穩定保存28天。

        該結果來自于對野生型KRAS DNA濃度的檢測:Blood Exo DNA ProTeck® tubes能讓血液中的KRAS DNA室溫(22?C)穩定保存28天,而K3EDTA保存管無法實現。

        將來源于細胞系的已知量的KRAS外顯子2 G13D突變的腫瘤cell-free DNA作為內參照加入到采集的血樣中,使用therasreen KRAS RGQ PCR試劑盒和Rotor Gene real time PCR儀檢此內參。在K3EDTA采血管保存的血樣中,發現僅在采集日可以檢出,而Blood Exo DNA ProTeck® tubes中保存的血樣,22°C下保存28天依舊可以檢出。

        3. 溫度穩定性(Temperature stability)

        使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血在4?C到30?C間都能保持cell-free DNA穩定。

        無論使用Qubit® dsDNA HS檢測法,還是使用droplet digital PCR檢測RASSF1A,在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中,6?C, 22?C或37?C三種保存溫度下保存的血液,直到第7天cell-free DNA濃度都沒有顯著改變。

        4. 運輸穩定性(Shipping stability)

        使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集保存的血樣能經受42?C溫度,不影響血中cell-free DNA濃度。

        實驗方法:將ProTeck采血管采集的血樣,通過FedEx運輸往哥倫比亞,亞利桑那等地,經受兩天42?C,與室溫保存的樣品比較cell-free DNA濃度沒有顯著改變,而在K3EDTA管中保存的血樣cell-free DNA濃度顯著升高(droplet digital PCR技術檢測β-Actin基因片段)。

        5.甲醛檢測

        NMR檢測顯示CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tube不含甲醛。

       

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