華雅旗下 紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司 授權(quán)代理Rubicon Genomics 文庫(kù)制備試劑 R400407/RB4407為期貨詳詢(xún)  紅榮微再-客服  經(jīng)銷(xiāo)商專(zhuān)員

ThruPLEX DNA-seq以pg級(jí)微量DNA作為起始樣本構(gòu)建文庫(kù)，特別設(shè)計(jì)接頭免去了中間純化步驟，簡(jiǎn)化了文庫(kù)制備流程，整個(gè)實(shí)驗(yàn)只需15分鐘手動(dòng)操作且為1個(gè)反應(yīng)管、2個(gè)小時(shí)、3步反應(yīng)的簡(jiǎn)單過(guò)程。尤其適合少量細(xì)胞起始的ChIP測(cè)序。

Rubicon ThruPLEX DNA-seq Kit

NGS新一代測(cè)序微量樣本DNA文庫(kù)制備試劑

英文名稱(chēng)：ThruPLEX DNA-seq 96D Kit

中文名稱(chēng)：DNA測(cè)序文庫(kù)制備試劑

貨號(hào)：R400407或RB4407（舊貨號(hào)）

品牌：Rubicon Genomics

加樣量 50 pg - 50 ng

反應(yīng)時(shí)間 2小時(shí)

手動(dòng)操作 15 min

操作步驟 3步

類(lèi)型 完整試劑盒，包含illumina測(cè)序索引（indexes）

適合樣本 所有打斷的雙鏈DNA

ThruPLEX DNA測(cè)序文庫(kù)制備試劑基于ThruPLEX化學(xué)技術(shù)制備DNA文庫(kù)，文庫(kù)的多重測(cè)序能力提高，具有更高多樣性。試劑zui高包含96個(gè)illumina兼容索引（indexes）。ThruPLEX DNA測(cè)序文庫(kù)制備試劑可用于DNA/RNA 測(cè)序和ChIP測(cè)序，并與主流目標(biāo)區(qū)域富集平臺(tái)兼容。

ThruPLEX DNA-seq應(yīng)用

全基因組測(cè)序（WGS）

全外顯子組測(cè)序（WES）

靶向測(cè)序

染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序（ChIP-seq）

RNA-seq

應(yīng)用特別介紹：ChIP-seq

ChIP-seq引用文獻(xiàn)：2016至今有11篇ThruPLEX用于ChIP-seq 的高影響因子文章發(fā)表。

簡(jiǎn)單的工作流程：3個(gè)反應(yīng)步驟在一個(gè)管內(nèi)進(jìn)行，只需2h，手動(dòng)操作15min

模板修復(fù)—末端連接—擴(kuò)增

組份：

分模板準(zhǔn)備、文庫(kù)合成和文庫(kù)擴(kuò)增三大部分。保存-20℃。

模板準(zhǔn)備緩沖液+模板準(zhǔn)備酶（紅色）

文庫(kù)合成緩沖液+文庫(kù)合成酶（黃色）

文庫(kù)擴(kuò)增緩沖液+文庫(kù)擴(kuò)增酶（綠色）

Illumina索引（indexing） 試劑（藍(lán)色）

無(wú)核酸酶水（無(wú)色）

ThruPLEX DNA-seq特點(diǎn)

高靈敏度、高性能：以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料，尤其適合ChIP-DNA

快速簡(jiǎn)便的工作流程：?jiǎn)喂芑騿慰?/span>3步操作，2小時(shí)，無(wú)需轉(zhuǎn)移操作

可重復(fù)的結(jié)果：構(gòu)建文庫(kù)具有高多樣性、低重復(fù)度和GC偏差

完整的文庫(kù)構(gòu)建試劑：優(yōu)化的illumina index引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無(wú)核酸酶水

兼容主流目標(biāo)區(qū)域富集平臺(tái)：Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes

ThruPLEX技術(shù)—莖環(huán)形 接頭

莖環(huán)形接頭的特別設(shè)計(jì)，能夠有效抑制二聚體的形成，免去了大多數(shù)Illumina等文庫(kù)制備技術(shù)需要的中間純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。整個(gè)實(shí)驗(yàn)只需15分鐘手動(dòng)操作且為1個(gè)反應(yīng)管、2個(gè)小時(shí)、3步反應(yīng)的簡(jiǎn)單過(guò)程。僅在PCR反應(yīng)后進(jìn)行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對(duì)珍貴樣品進(jìn)行有效分析。

莖環(huán)形接頭的設(shè)計(jì)降低實(shí)驗(yàn)背景，免去了中間純化步驟。

ThruPLEX DNA-seq 制備文庫(kù)高多樣性 低重復(fù)度 低GC偏差

ThruPLEX DNA-seq Kit 優(yōu)于其他NGS文庫(kù)制備試劑。與其他試劑相比，ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA，構(gòu)建多樣性更好（左圖），重復(fù)更少（右圖）的文庫(kù)（25 M read pairs）。NGS文庫(kù)分別采用圖示對(duì)照gDNA起始量，以相應(yīng)的文庫(kù)制備試劑制備，采用MiSeq v3 flow cell測(cè)序。

ThruPLEX DNA-seq Kit 減少了GC偏差。以人類(lèi)基因組相對(duì)覆蓋度為GC含量（%）的函數(shù)（50 ng DNA起始）。（左圖）ThruPLEX DNA-seq Kit 在整個(gè)范圍內(nèi)都有出色的覆蓋。（右圖）ThruPLEX DNA-seq Kit （金色）與參試的其他試劑一樣好或更好。請(qǐng)注意，在這些圖中的覆蓋度應(yīng)該為1。人類(lèi)基因組中的GC含量分布以紅色柱形圖表示。

自備試劑：

Agencourt®XP 核酸純化磁珠（Beckman Coulter，目錄號(hào)A63880）

引用文獻(xiàn)：

2017年以來(lái)，谷歌學(xué)術(shù)上搜索Rubicon ThruPLEX DNA-seq 有94篇文獻(xiàn)。

背景介紹

新一代測(cè)序（英文名稱(chēng)Next Generation Sequencing，縮寫(xiě)NGS）是一個(gè)需求快速發(fā)展的動(dòng)態(tài)領(lǐng)域。無(wú)論樣品類(lèi)型或應(yīng)用如何，每個(gè)樣品都需要制備DNA文庫(kù)，以便在Illumina NGS平臺(tái)上進(jìn)行測(cè)序。

文庫(kù)制備過(guò)程（下圖）涉及將Illumina測(cè)序接頭與片段DNA連接并添加Illumina兼容索引（indexes）以允許多個(gè)樣本的流動(dòng)池混合測(cè)序（多重平行測(cè)序）。文庫(kù)制備是NGS操作流程的關(guān)鍵步驟，并直接影響測(cè)序結(jié)果的質(zhì)量。

隨著NGS臨床應(yīng)用的出現(xiàn)以及隨著NGS測(cè)序儀器功能的日益強(qiáng)大，研究人員和臨床醫(yī)師正在越來(lái)越多地調(diào)查更加困難和具有挑戰(zhàn)性的樣品，這些樣品數(shù)量有限，使用量少，有的還受損。在許多應(yīng)用中，例如來(lái)自血漿的游離DNA，樣品DNA材料有限且高度降解。

在DNA樣本比較珍貴時(shí)，例如腫瘤組織的分析，使用少量樣本的能力可以盡可能多的保存樣本用于多種用途。臨床樣品還需要仔細(xì)追蹤樣品，樣品從不離開(kāi)試管的方案有利于確保準(zhǔn)確的樣品追蹤并避免污染。這種不斷增長(zhǎng)的趨勢(shì)需要文庫(kù)制備試劑盒，它能夠以簡(jiǎn)單的工作流程精確地保留樣本的復(fù)雜性并提供更高的靈敏度和更高的多重測(cè)序能力。

滿(mǎn)足這些需求是ThruPLEX DNA測(cè)序試劑的核心。它的開(kāi)發(fā)旨在提高多重測(cè)序能力，并從少量樣本制備高品質(zhì)、兼容Illumina的NGS文庫(kù)。ThruPLEX DNA-seq的三步式單管文庫(kù)制備是業(yè)界zui簡(jiǎn)單的操作流程，可zui大限度地減少處理錯(cuò)誤和寶貴樣品的損失。

名詞解釋?zhuān)篊hIP-seq 結(jié)合DNA測(cè)序分析蛋白與DNA的相互作用，確定DNA相關(guān)蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。

ChIP：染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱(chēng)結(jié)合位點(diǎn)分析法。

ChIP測(cè)序也稱(chēng)為ChIP-seq，是一種用于分析蛋白質(zhì)與DNA相互作用的方法。 ChIP-seq將染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）與大規(guī)模平行DNA測(cè)序相結(jié)合，以確定DNA相關(guān)蛋白的結(jié)合位點(diǎn)。它可以用來(lái)精確地定位任何目標(biāo)蛋白質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)。

ThruPLEX DNA-seq訂購(gòu)信息

R400407/RB4407為期貨

Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國(guó)密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù)，檢控嚴(yán)格，擁有cGMP級(jí)生產(chǎn)能力，是單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建的。2017年1月，Rubicon 成為T(mén)akara的一員，并且發(fā)展良好。

華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司主營(yíng)細(xì)胞治療和精準(zhǔn)醫(yī)療等產(chǎn)品，2018年與TAKARA繼續(xù)合作，授權(quán)代理（上海）其旗下Rubicon單細(xì)胞文庫(kù)構(gòu)建試劑等產(chǎn)品。

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